Buku ini merupakan acuan dalam melakukan tahapan analisis sekuen DNA bagi pengguna yang tertarik di bidang genetika, biologi molekuler, dan bioteknologi. Langkah-langkah dasar dalam analisis mulai dari pengumpulan sumber referensi untuk dasar analisis yang tepat sampai dengan analisis sekuen untuk mengetahui adanya perbedaan variasi sekuen DNA pada kambing dan domba disampaikan dalam satu bab yang terpisah untuk masing-masing target gen yang dipelajari. Mata kuliah Genetika pada beberapa perguruan tinggi yang merupakan mata kuliah wajib, dan mata kuliah Dasar Analisis Genetik yang merupakan mata kuliah pilihan dapat memanfaatkan buku ini sebagai referensi untuk mengetahui perubahan susunan genetik pada setiap individu ternak.

Dalam rangka mendukung misi “meningkatkan penyelenggaraan riset berbasis keunggulan lokal dalam rangka pengembangan ilmu pengetahuan dan teknologi peternakan”, buku ajar ini menampilkan kumpulan hasil penelitian yang menggambarkan keragaman genetika pada kambing dan domba di Indonesia, baik dari hasil riset di laboratorium maupun dari hasil studi referensi jurnal. Studi referensi jurnal nasional maupun internasional yang dilakukan dosen, peneliti, asisten, dan mahasiswa bertujuan untuk memotivasi dan memberikan contoh kepada para peneliti, dosen, atau mahasiswa agar terlatih dalam mencari berbagai sumber pustaka primer dan menuliskan kembali dalam bentuk buku ajar berbasis riset.

Buku ini merupakan acuan dalam melakukan tahapan analisis sekuens DNA bagi pengguna yang tertarik di bidang genetika, biologi molekuler, dan bioteknologi. Langkah-langkah dasar dalam analisis mulai dari pengumpulan sumber referensi untuk dasar analisis yang tepat sampai dengan analisis sekuens untuk mengetahui adanya perbedaan variasi sekuens DNA pada kambing dan domba disampaikan dalam satu bab terpisah untuk masing-masing target gen yang dipelajari.

Mata kuliah Genetika pada beberapa perguruan tinggi merupakan mata kuliah wajib dan mata kuliah Dasar Analisis Genetik merupakan mata kuliah pilihan dapat memanfaatkan buku ini sebagai referensi untuk mengetahui perubahan susunan genetik pada setiap individu ternak.

Dalam rangka mendukung misi “Meningkatkan penyelenggaraan riset berbasis keunggulan lokal dalam rangka pengembangan ilmu pengetahuan dan teknologi peternakan”, buku ajar ini menampilkan kumpulan hasil-hasil penelitian yang menggambarkan keragaman genetika pada kambing dan domba di Indonesia, baik dari hasil riset di laboratorium maupun dari hasil studi referensi jurnal. Studi referensi jurnal nasional maupun internasional yang dilakukan dosen, peneliti, asisten, dan mahasiswa bertujuan untuk memotivasi dan memberikan contoh kepada para peneliti, dosen, atau mahasiswa agar terlatih dalam mencari berbagai sumber pustaka primer dan menuliskan kembali dalam bentuk buku ajar berbasis riset.

Semoga buku ajar berbasis riset ini dapat bermanfaat bagi mahasiswa dan dosen, peneliti, maupun siapa saja yang tertarik dengan dunia penelitian ternak sebagai acuan dalam melakukan analisis genetik pada ternak dan khusus bagi dosen dapat digunakan untuk pengembangan metode pembelajaran. Buku ini dapat menjadi acuan persiapan penelitian dan selanjutnya dapat digunakan untuk meng-update materi pembelajaran sesuai perkembangan ilmu pengetahuan dan teknologi.

Yogyakarta, Agustus 2021


Penyusun

Sampul
Halaman Judul
Halaman Hak Cipta
Kata Pengantar
Daftar Isi
Daftar Tabel
Daftar Gambar
Bab I: Dasar Genetikadan Perkembangannya
     A. Sel Eukariot
     B. Sitoplasma
     C. Inti Sel
     D. Kromosom
     E. Pembelahan Sel
     F. Perkembangbiakan
     G. Perkembangan Ilmu Genetika
     H. Manfaat Bioteknologi dalam Analisis Genetikpada Ternak
     Tugas/Latihan
Bab II: Studi Dna Mitokondria D-Loop Pada Kambing Dan Domba
     A. Identifikasi Lokus DNA Mitokondria D-Loop pada Kambing dan Domba
     B. Penelusuran Informasi MTDNA D-Loop dari Hasi l Studi Referensi
     C. Pendataan Daftar GenBank MTDNA D-Loop yang Diperoleh dari Referensi Jurnal
     D. Pendataan Daftar Primer MTDNA D-Loop yang Diperoleh dari Referensi Jurnal
     E. Pencarian Informasi Tentang MTDNA D-Loop dari Database NCBI
     F. Restriction Mapping
     G. Analisis Enzim Retriksi Menggunakan Bioedit
     H. Analisis Enzim Retriksi Menggunakan program Nebcutter
     I. Penyejajaran Sekuens MTDNA D-Loop
     Tugas/Latihan
Bab III: Studi Dna Mitokondria Lokus Cytochrome B Pada Kambing Dan Domba
     A. Identifikasi Gen Cyt-b Berdasarkan Studi Referensi
     B. Analisis Lokus Gen Cyt-b
     C. Analisis Enzim Restriksi Menggunakan BioEdit
     D. Analisis Enzim Restriksi Menggunakan Nebcutter
     E. Penyejajaran Sekuens
     Tugas /Latihan
Bab IV: Studi Gen Bone Morphogenetic Proteins (BMP) Pada Kambing Dan Domba
     A. Pengantar Studi Gen BMP pada Kambing dan Domba
     B. Identifikasi Lokus Gen BMP Pada Kambing Dan Domba
     C. Peta Enzim Restriksi Gen BMP
     D. Analisis Enzim Restriksi Menggunakan BioEdit
     E. Analisis Enzim Restriksi Menggunakan Nebcutter
     F. Analisis Chi-square
     G. Penyejajaran Sekuens
     Tugas /Latihan
Bab V: Studi Gen Sry Pada Kambing Dan Domba
     A. Identifikasi Gen Sry Berdasrkan Studi Referensi
     B. Beberapa Data Gen SRY yang Diperoleh dari GenBank
     C. Hasil Penelusuran Lokus Gen SRY
     D. Analisis Sekuens pada Lokus Gen SRY
     E. Analisis Enzim Restriksi
     F. Penyejajaran Sekuens
     Tugas /Latihan
Bab VI: Studi Gen Growth Hormone (GH) Pada Kambing dan Domba
     A. Identifikasi Gen GH Berdasarkan Studi Referensi
     B. Analisis Lokus Gen GH
     C. Analisis Enzim Restriksi Menggunakan BioEdit
     D. Analisis Enzim Restriksi Menggunakan Nebcutter
     E. Penyejajaran Sekuens
     Tugas/Latihan
Bab VII: Studi Gen MC1R Pada Kambing Dan Domba
     A. Identifikasi Gen Melanocortin-1 Reseptor(MC1R) Berdasarkan Studi Referensi
     B. Analisis Enzim Restriksi Menggunakan Nebcutter
     C. Analisis Enzim Restriksi Menggunakan Bioedit
     D. Penyejajaran Sekuens
     E. Single Nucleotide Polymorphisms (SNPs)
     Tugas /Latihan
Bab VIII:  Penutup
Glosarium
Daftar Pustaka
Kontributor
Indeks
Tentang Penulis